大多數的用戶在使用食品保鮮冷庫時，都會有這樣的一個錯誤做法，那就是還未對食品冷庫進行徹底的殺菌消毒立馬投入使用；殊不知這種做法會直接影響庫內食品的儲藏效果，滋生了大量的細菌和病菌，影響了食物的品質。

對食品進行冷加工，并不能改善和提高食品的質量，僅是通過低溫處理，抑制微生物的活動，達到較長時間貯藏的目的。因此，在冷庫的使用中，冷庫的衛生管理是一項重要工作。要嚴格執行國家辦法的衛生條例，盡可能減少微生物污染食品的機會，以保證品是質量，延長貯藏期限。

由于食品保鮮冷庫儲藏的物品，大多都含有十分豐富的蛋白質，脂肪，淀粉等含量，這些物質會成為霉菌，細菌，病菌大量繁殖的天堂；如若不及時對保鮮冷庫進行殺菌消毒，就會使得庫內的物品受到了病菌細菌的侵蝕。因此，食品保鮮冷庫在投產使用之前，一定要使用專業的冷庫殺毒劑乳酸，漂白粉，福爾馬林，雙氧水，過氧乙酸等不止對冷庫進行徹底的殺菌消毒處理。

冷庫的庫房是進行食品冷加工和長期存放的地方，庫房的衛生管理工作，是整個冷庫衛生管理的中心環節。

在庫房內霉菌比細菌繁殖得更快，并且極易侵害食品。因此，庫房應該進行不定期的消毒工作。

運貨用的手推車以及其他載貨設備也能成為微生物污染食品的媒介，應該經常進行清洗和消毒。

冷庫的庫房內踉蹌的食品，不論是否有包裝，都要對方在墊木上。墊木應該進行拋光，并保持清潔。墊木、小車以及其他設備，要定期在冷庫外沖洗、消毒。可先用熱水沖洗，并用2%濃度的堿水（50℃）除油污，然后用含有效氯0.3%~0.4%的漂白粉溶液進行消毒。加工用的一切設備，如鐵盤、掛鉤、工作臺等，在使用前后都應該用清水沖洗干凈，必要時還要用熱堿水消毒。

冷庫內部的走道和樓梯要經常清掃，特別在出入冷庫的時候，對地坪上的碎肉等殘留物要及時清掃，以免污染環境。