制冷壓縮機是冷庫設備的心臟，它消耗的能量在整個制冷系統中占很大的比例。對于特定的制冷量，選擇不同的壓縮機直接關系到運行的能耗。在大中型冷庫的建設中，液氨制冷螺桿制冷壓縮機已有取代活塞式壓縮機的趨勢。在冷凝溫度35℃，蒸發溫度為-28℃(-33℃)的典型工況下，當制冷量大于450kw時，應選用螺桿壓縮機，在初期投資、運行費用等方面均比活塞式壓縮機合理。但在選用機組數量時，必須考慮到冷庫低峰負荷、中等負荷和高峰負荷時機組能量的合理搭配，避免螺桿壓縮機能量調節在50%以下的工況長時間運行。對蒸發溫度在-45℃左右的大中型速凍庫，可采用由多臺大制冷量的螺桿壓縮機組成的組配式雙壓縮制冷系統，節能效果顯著。

不少冷庫在制冷壓縮機的配置上存在的問題是設計時所選配的壓縮機滿負荷運行的時間較短，低負荷運行的時間較長，即壓縮機大部分的運行時間處于小于設計負荷的工況下運行，使壓縮機的制冷量與實際冷負荷不相匹配，造成冷庫的能耗增加。因此，必須正確估計冷庫實際耗冷量的變化，掌握冷藏過程中放熱量及外界氣溫、冷卻水溫和日常操作熱量等耗冷量的變化規律，合理調整壓縮機的開啟臺數，或通過卸載裝置減少壓縮機的工作缸數。